ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА IN SILICO ДЛЯ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ СВОЙСТВ БИОАКТИВНЫХ ПЕПТИДОВ
Аннотация и ключевые слова
Аннотация (русский):
Цель работы – проведение исследований по изучению накопления биоактивных пептидов в процессе созревания полутвердых сыров в зависимости от штаммов микроорганизмов, входящих в заквасочные культуры, методом in silico. Задачи: провести выработку модельных полутвердых сыров при участии стартерных культур, содержащих штаммы; олределить химический состав модельных полутвердых сыров в возрасте 90 дней, а также их пептидную последовательность; изучить влияние штаммов старторных культур на биоактивность и другие свойства пептидов модельных полутвердых сортов. Для проведения исследований были использованы модельные образцы полутвердых сыров, выработанные в цехе научно-экспериментальных основ пищевых систем при Технологическом институте пищевой промышленности Кемеровского государственного университета (КемГУ), в двух вариациях: сыр А – использовали заквасочные культуры, состоящие из штаммов микроорганизмов Lactococcus lactis subs. lactis и Lactococcus lactis subs. cremoris; сыр В – из штаммов микроорганизмов Lactococcus lactis subs. lactis и Lactococcus lactis subsp. Cremoris, и культуру, содержащую бактерии Lactocaseibacillus casei. Путем оценки биоактивных свойств методом in silico определили, что исследуемые образцы пептидов обладают следующими основными свойствами: ингибиторы АПФ, ингибитор DPP-IV и антиоксидантные свойства. В связи с этим можно предположить, что при регулярном употреблении зрелых сыров в рационе питания можно избежать приема фармакологических препаратов.

Ключевые слова:
биоактивные пептиды, полутвердые сыры, Lactococcus lactis, Lactococcus cremoris, Lactocaseibacillus casei
Текст
Текст (PDF): Читать Скачать

Введение. В последнее время у научного сообщества растет интерес к открытию новых биоактивных соединений, которые возможно выделить из пищевых продуктов или веществ, что дает большие возможности к получению новых пептидов с фармакологическими эффектами. Биоактивные пептиды – это молекулы, обладающие потенциальной биологической активностью, которая может оказывать влияние на некоторые функции организма и здоровье человека в целом. Они считаются альтернативой для профилактики различных метаболических заболеваний, так как обладают широким спектром действия, менее аллергенны, проявляют высокую биоспецифическую активность и структурное разнообразие. Ввиду того, что различные сыры являются высокобелковыми продуктами, а большинство из них во время созревания подвергается протеолизу различной степени, их можно рассматривать как альтернативный источник для разработки нового поколения функциональных продуктов или биологически активных веществ.

В настоящее время идентифицированы и выделены сотни пептидов с различной биологической активностью из различных пищевых источников, включая молоко, сыворотку, яйца, рыбу, рис, сою, арахис, нут, кукурузу и водоросли [1, 2]. Однако лишь немногие из них представлены на рынке как функциональные продукты нутрицевтики. Например, биоактивные пептиды, полученные из молока и рыбы, широко представлены на современном рынке пищевых ингредиентов по сравнению с пептидами из других пищевых источников. Антиоксидантные пептиды обычно содержат в своей структуре гидрофобные аминокислоты и остатки гистидина, фенилаланина, триптофана или тирозина [3, 4].

Цель провести исследование по накоплению биоактивных пептидов и их свойств в зрелых полутвердых сырах методом in silico.

Задачи: провести выработку модельных полутвердых сыров при участии стартерных культур, содержащих штаммы – Lactococcus lactis subspecies lactis (далее Lc. lactis subs. lactis), Lactococcus lactis subspecies cremoris (далее Lc. lactis subs. cremoris) и Lactocaseibacillus casei (далее L. сasei); провести определение химического состава модельных полутвердых сыров в возрасте 90 дней, а также их пептидную последовательность; изучить влияние штаммов старторных культур на биоактивность и другие свойства пептидов модельных полутвердых сыров.

Объекты и методы. Для проведения исследований были использованы модельные образцы полутвердых сыров, полученные в лабораторных условиях. В качестве стартерных культур для контрольного образца сыра (сыр А) использовалась подготовленная бактериальная мезофильная культура МО/032 (фирмы Lyofast), содержащая штаммы – Lc. lactis subs. lactis и Lc. lactis subs. cremoris – 0,5 % от объема молока; для опытного образца (сыр В) дополнительно использовали культуру LC4P1 (фирмы Lyofast), содержащую бактерии L. casei.

Основные параметры производства модельных образцов полутвердого сыра: температура пастеризации нормализованной смеси 74 °С, выдержка 20 с; температура инокуляции 34 °С; время инокуляции 10 мин; мультипликатор флокуляции 3; нарезка кубиков размером 1,0×1,0 см; температура второго нагревания 45 °С; рН при сливе сыворотки 6,2–6,35; стуфатура 1,5 ч; срок аффинажа сыров 90 дней при температуре 12–14 °С и относительной влажности воздуха 80–85 %.

Химический состав молока и сыров определяли по общепринятым методикам: массовую долю жира – кислотным методом Гербера (ГОСТ 5867), массовую долю белка в молоке – рефрактометрическим методом (ГОСТ 251793), массовую долю сухого вещества – по ГОСТ 3623. Массовую долю белка определяли на анализаторе общего азота (белка) RapidN Elementar, работающего по методу Дюма – сжигание пробы с регистрацией общего азота на детекторе теплопроводности. Аминокислотная последовательность пептидов исследуемых образцов гидролизатов была определена методом матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией на приборе MALDI Biotyper, Bruker. Степень биоактивности исследуемых пептидов оценивали методом in silico с помощью онлайн-сервера PeptideRanker, который ранжирует пептиды по прогнозируемой вероятности того, что пептид будет биологически активным. Моделирование структуры проводили с помощью сервиса SWISS-MODEL, который включает в себя репозиторий SWISS-MODEL и рабочее пространство SWISS-MODEL. С помощью базы данных биоактивных пептидов молока MBPDB проводили поиск, идентификацию белка и определение свойств исследуемых пептидов.

Экспериментальные исследования проводились на базе кафедры технологии продуктов питания животного Кемеровского государственного университета.

Результаты и их обсуждение. Для исследований были выработаны несколько модельных образцов полутвердого сыра. Аффинаж модельных сыров протекал при температуре 12–14 °С и относительной влажности 80–85 %. Химический состав сыра и активную кислотность определяли через 90 дней (табл. 1).

 

 

Таблица 1

Химический состав модельных сыров в возрасте 90 дней, %

 

Показатель

Сыр А* (контрольный)

Сыр В** (опытный)

Массовая доля сухих веществ

55,16 ± 0,21

54,85 ± 0,23

Массовая доля жира в сухом веществе

48,93 ± 1,95

49,50 ± 1,04

Массовая доля общего белка

20,23 ± 0,28

21,23 ± 0,31

Массовая доля соли

2,34 ± 0,72

3,13 ± 0,55

*Сыр А – использовали закваску, в состав которой входили штаммы микроорганизмов Lc. lactis subs. lactis, Lc. lactis subs. Cremoris.

**Сыр В – использовали закваску, в состав которой входили штаммы микроорганизмов Lc. lactis subs. lactis, Lc. lactis subs. cremoris – и L.casei в соотношении 0,5 + 0,5 %.

 

Анализ результатов, представленных в таблице 1, показал, что химический состав сыров практически одинаков в модельных образцах. Активная кислотность была ниже у опытных образцов сыра В и составила 4,13 ± 0,06 ед., где дополнительно к основной культуре вносили бактерии L. casei, в образцах сыра А активная кислотность составляла 4,74 ± 0,18 ед.

Протеолитическая активность при созревании сыра зависит от нескольких факторов, таких как тип используемого коагулянта; нативная микрофлора молока и штаммы микроорганизмов, входящих в заквасочные культуры; остаточное действие коагулянта и нативных молочных протеаз, на которые может влиять содержание влаги в сыре, а также температура и относительная влажность сыра, условия аффинажа.

После 90-суточного аффинажа в исследуемых сырах проводили определение пептидных последовательностей и их биоактивности. В результате определения аминокислотной последовательности всего выявлено 115 пептидных последовательностей, в т. ч. в образце А – 91 пептидная последовательность, в образце В – 64, при этом потенциально биоактивных 20. Данные образцы имеют биоактивность от 0,547239 до 0,870583 единиц. Далее проводили проверку биоактивных свойств выявленных пептидных последовательностей с помощью доступных онлайн-серверов, основанных на общедоступных данных по биоактивным свойствам известных пептидов.

Дальнейшие исследования проводили методом in silico с помощью онлайн-ресурсов. В таблице 2 представлена характеристика биоактивных пептидов.

 

Таблица 2

Характеристика потенциальных биоактивных пептидов

 

Вид сыра

Пептидная

последовательность

Биоактивность*

Потенциальные биоактивные свойства**

A, B

PSGAW

0,870583

Ингибиторы АПФ

A, B

MKPWI

0,853622

Ингибиторы АПФ

B

SCDKFL

0,844337

Ингибиторы АПФ

A, B

PPTVMF

0,826762

Ингибитор DPP-IV

A

TFPGPIP

0,774112

Ингибитор DPP-IV

A

PSYGL

0,748397

Опиоид

A

MMKSF

0,730558

Ингибиторы АПФ

A

PEWVCTTF

0,703949

Ингибиторы АПФ

A

NNQFL

0,693175

Ингибитор DPP-IV

A

PKYPVEPF

0,630562

Антиоксидант

A, B

GGVSLPEW

0,628953

Ингибиторы АПФ

B

SFNPTQL

0,619614

Ингибиторы АПФ

B

CKDDQNPHSSNICNI

0,61108

Антимикробный

A

PVEPF

0,604782

Опиоид, ингибитор DPP-IV, антиоксидант

A

QWQVL

0,584037

Иммуномодулирующие

A, B

SDIPNPI

0,573163

Стимулирующие рост

A

PSFSDI

0,547239

Противораковый, антимикробный

* Оценивали методом in silico с помощью онлайн-сервера PeptideRanker.

** Базы данных биоактивных пептидов молока MBPDB.

 

Из результатов оценки биоактивных пептидов (табл. 2) видно, что исследуемые образцы обладают следующими основными свойствами: ингибиторы АПФ, ингибитор DPP-IV и антиоксидантные свойства. Можно отметить, что по результатам исследований in silico исследуемые штаммы микроорганизмов Lc. lactis subs. lactis и Lc. lactis subs. cremoris, которые использовались для производства контрольного образца сыра, в большей степени влияют на образование биоактивных пептидов. Так, у сыров контрольного образца было образованно 13 биоактивных пептидных последовательностей, при этом у сыра опытного образца В, содержащего бактерии L. Casei, – 7. Анализируя данные биоактивности пептидов в зрелых образцах модельного сыра можно остановиться на пептидной последовательности SCDKFL с высокой биоактивностью пептидов 0,8444337, которая встречается только в сыре В, где наряду с традиционными штаммами микроорганизмов использовали «сырную палочку» L. casei. Для сравнения интерес представляли также пептидные последовательности, которые встречались в контрольных (А) и опытных (В) образцах сыра и имели высокую биоактивность пептидов – MKPWI и PSGAW, с активностью 0,853622 и 0, 870583 соответственно.

Далее, с помощью онлайн-ресурсов, были разработаны модели структуры белков исследуемых сыров (рис.). Также на рисунке представлены обнаруженные участки структуры биоактивных пептидов исследуемых образцов сыра A и B.

 

 

Образец А

Образец B

 

Обнаруженные участки структуры биоактивных пептидов

(стрелки указывают на расположение пептидной последовательности

в общей структуре белковой молекулы)

 

 

Оценивая структуру данных пептидов, можно сделать вывод о том, что выявленные биоактивные пептиды имеют ароматические кольца, которые в основном представлены аминокислотами триптофан, тирозин и фенилаланин.

Примечательно то, что все эти последовательности по своим биоактивным свойствам являются ингибиторами ангиотензин-превращающего фермента (АПФ). Для организма человека ингибиторы АПФ обладают многофакторными действиями, такими как, например, расслабление кровеносных сосудов, что снижает артериальное давление.

В медицинской практике доказано, что применение ингибиторов АПФ снижает частоту случаев госпитализации при сердечной недостаточности, повышает продолжительность жизни, переносимость физической нагрузки и качество жизни в целом [5].

Заключение. В связи с этим можно предположить, что биоактивные пептиды, находящиеся в зрелом сыре, могут выполнять роль ингибиторов АПФ. В свою очередь, при регулярном употреблении зрелых сыров в рационе питания можно избежать приема фармакологических препаратов. Принадлежность к функциональным продуктам самих сыров можно рассматривать в другом разрезе, что и попытались отразить в данной работе. Представленное направление вызывает научный интерес и возможность прогнозировать накопление биоактивных пептидов в разных группах сыров за счет использования различных штаммов микроорганизмов в заквасочных культурах.

Список литературы

1. Cunha S.A., Pintado M.E. Bioactive Peptides Derived from Marine Sources: Biological and Functional Properties // Trends in Food Science & Technology. 2022. Vol. 119. P. 348–370. DOI:https://doi.org/10.1016/j.tifs.2021.08.017.

2. Identifying bioactive peptides from poultry by-products / R.A. Voroshilin [et al.] // Food Processing: Techniques and Technology. 2022. Vol. 52. № 3. P. 545–554. DOI: 10.21603/ 2074-9414-2022-3-2387.

3. Milentyeva I.S., Davydenko N.I., Raschepkin A.N. Casein Proteolysis in Bioactive Peptide Production: Optimal Operating Parameters // Food Processing: Techniques and Technology. 2020. № 4 (50). P. 726–735. DOI:https://doi.org/10.21603/2074-9414-2020-4-726-735.

4. Bioactive Peptides: From Structure to Human Health / P.A. Trinidad-Calderón [et al.] // Journal of Cereal Science. 2021. Vol. 100. P. 103232. DOI:https://doi.org/10.1016/j.jcs.2021.103232.

5. Improving Human Health with Milk Fat Globule Membrane, Lactic Acid Bacteria, and Bifidobacteria / E. Kosmerl [et al.] // Microorganisms. 2021. Vol. 9 (2). DOI:https://doi.org/10.3390/microorganisms 9020341.


Войти или Создать
* Забыли пароль?